В Университете реализуется целый ряд образовательных программ высшего образования: 38 программ подготовки бакалавров, 34 программ подготовки магистров и 40 программ подготовки специалистов.

Программы высшего образования реализуются в соответствии с федеральными стандартами, которые устанавливают минимальные требования к содержанию программ и качеству образования.

До 2010 года осуществлялся прием на обучение в соответствии с государственными образовательными программами высшего профессионального образования (ГОС ВПО). На данный момент в университете производится доучивание по 24 программам подготовки специалистов, реализуемым в соответствии с ГОС ВПО.

С 2010 года ГОС ВПО были заменены на федеральные государственные образовательные программы высшего профессионального образования (ФГОС ВПО). В связи с вступлением в силу Федерального закона «Об образовании в Российской Федерации», стандарты ФГОС ВПО заменяются (по мере утверждении и опубликования) на стандарты ФГОС ВО 3+.

Система Orphus